กรณีการกล่าวเท็จของ นายสมบูรณ์ ทองบุราณ ผู้ซึ่งกำลังถูกดำเนินคดีก่อการร้ายกรณีร่วมกับพันธมิตรประชาชนเพื่อประชาธิปไตยปิดสนามบินสุวรรณภูมิ, ผอ.ช่อง13 สยามไท และอดีต ส.ว.ยโสธร ที่ว่าระบุมีชายชุดดำที่วัดพระธรรมกายนั้น ทางวัดขอปฏิเสธว่าไม่เป็นความจริงแต่ประการใด เป็นการกล่าวโกหก กล่าวเท็จ กล่าวใส่ร้ายป้ายสีโดยไม่มีมูล กรุณาอย่านำวัดไปยุ่งเกี่ยวกับความเห็นทางการเมืองโดยใช้ข่าวลือที่ไม่เป็นความจริง เพราะไม่เป็นประโยชน์แต่ประการใดเลย
เนื่องด้วยนายไพบูลย์ นิติตะวัน และพระสุวิทย์ วัดอ้อน้อย ซึ่งเป็นตัวตั้งตัวตีในการกดดันให้ดำเนินคดีกับพระเทพญาณมหามุนีนั้น เป็นผู้ต้องหาในคดีกบฏจากการ shut down กรุงเทพฯ ตามสำนวนคดีพิเศษที่ ๒๖๑/๒๕๕๖ คณะศิษยานุศิษย์วัดพระธรรมกายจึงขอเรียนถามความคืบหน้าในการดำเนินคดีดังกล่าว และพฤติกรรมที่เกี่ยวข้องจากกรมสอบสวนคดีพิเศษ ดังนี้
ตามที่มีรายงานข่าวในสื่อมวลชนว่า ทางกรมสอบสวนคดีพิเศษได้ไปแจ้งความดำเนินคดีกับพระมหาบุญชัย จารุทัตโต ผู้ดูแลการเงินของวัดพระธรรมกาย ในข้อหาขัดหมายเรียกนั้น วัดพระธรรมกายขอชี้แจงข้อเท็จจริง ดังนี้
กรณีที่ทางวัดพระธรรมกาย ได้ยื่นแจ้งขอเลื่อนนัดรับทราบข้อกล่าวหาของพระเทพญาณมหามุนี (หลวงพ่อธัมมชโย) ต่อ พนักงานสอบสวนคดีพิเศษ กรมสอบสวนคดีพิเศษ (ดีเอสไอ) และทางดีเอสไอมีความเห็นว่า “มีการเข้าร่วมพิธีกรรมทางศาสนาต่างๆ ได้เป็นปกติ” นั้น ขอชี้แจงดังนี้
ขอชี้แจงว่า ขณะนี้ ได้มีองค์กรพุทธศาสนาในรัฐมหาราษฎร์ประเทศอินเดีย จดทะเบียนองค์กรในชื่อ "Dhammakaya Foundation India" เพื่อสร้างความเข้าใจว่า องค์กรของตนเองนั้น เป็นสาขาของมูลนิธิธรรมกาย รวมทั้งอาจจะยังมีจุดประสงค์เพื่อแสวงหาประโยชน์จากพุทธศาสนิกไทยและประเทศอื่นๆอีกด้วย
คำชี้แจงวัดพระธรรมกาย วันที่ 9 มีนาคม พ.ศ. 2560
แถลงการณ์วัดพระธรรมกาย วันที่ 8 มีนาคม พ.ศ.2560 วันที่ 21 ของการที่วัดพระธรรมกาย ถูกละเมิดสิทธิมนุษยชน และรัฐใช้งบประมาณไปแล้วไม่ต่ำกว่า 60 – 100 ล้านบาท "ประเทศไทยเป็นเมืองพุทธจริงหรือ ทำไมใช้กฎหมายแกล้งฆ่าพระ"
จากเหตุการณ์โศกนาฏกรรม ที่มีผู้เสียชีวิตถึง 2 ศพ ที่เกิดจากการใช้ กฎหมาย ม.44 ที่ ปิดกั้นทางเข้าออกรอบวัดพระธรรมกาย คณะแพทย์พยาบาลอาสาวัดพระธรรมกาย ทีมกู้ชีพรัตนเวชรู้สึกสลดและโศกเศร้าใจเป็นอย่างมาก และไม่อยากให้เหตุการณ์อย่างนี้เกิดขึ้นอีก
คำชี้แจงวัดพระธรรมกาย วันที่ 7 มีนาคม 2560 เวลา 09:00 น.
วันที่( 28 ก.พ.) 11.30 น. คุณชินมอย บารัว และคณะพร้อมชาวพุทธญี่ปุ่น ในนามผู้แทนเครือข่ายองค์กรผู้นำพุทธโลก ยื่นหนังสือ ณ สถานทูตไทย ประจำญี่ปุ่น